仿刺參對時間序列壓力脅迫的分子響應
文章來源：供稿/供圖：陳家煒 | 發布時間：2020-04-30 | 【打印】 【關閉】
近日，中科院深海所張海濱研究團隊在期刊Frontiers in Genetics上發表了題為 “Molecular Response to High Hydrostatic Pressure: Time-Series Transcriptomic Analysis of Shallow-Water Sea Cucumber Apostichopus japonicus”的文章。研究團隊使用高壓培養裝置模擬深海高壓環境，通過轉錄組分析淺海仿刺參對壓力脅迫的分子響應。實驗包括：1.高壓環境時間序列(1–24 h)培養；2.進行高壓(25 MPa)培養后，在常壓條件下時間序列恢復(0.5–48 h)培養。
研究發現，參與基因信息傳遞的bZIP轉錄因子是對壓力變化最敏感的基因家族，在高壓培養2–4小時后開始顯著高表達。接下來產生響應的生物學過程是泛素化和細胞內吞，與這兩個生物學過程相關的基因家族分別在高壓培養4小時和6小時后開始顯著高表達。
另外，研究發現大部分基因在受到高壓脅迫后立即開始調整表達水平（此時尚未檢測到顯著差異），上調或者下調的速率隨時間增加逐漸降低；解除高壓脅迫后，大部分基因立即開始恢復，恢復速率隨時間增加逐漸降低（如圖示）。本研究的結果對深海動物的采樣具有一定的借鑒意義。由于深海樣品在回收至水面的過程中面臨劇烈的壓力變化，如需避免基因表達發生顯著改變，則應在盡量短的時間內完成對樣品的固定。深海所碩士生陳家煒為論文第一作者。
聚類分析、差異表達分析和主成分分析結果
P0–P24:高壓培養0–24小時
R0.5–R48：常壓恢復0.5–48小時
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